W celu wykonania raportu zgodności po zalogowaniu się do roli Zbiory centralne w oknie "Lista zbiorów centralnych" wskazujemy scalony zbiór centralny (może być scalony próbnie lub niezatwierdzony) dotyczący interesującego nas okresu sprawozdawczego, wybieramy operację Raport zgodności i potwierdzamy wybór ikoną 
:
Uwaga! Raport zgodności może wykonywać tylko użytkownik, pracujący na poziomie Województwa oraz Ministerstwa. W roli "Zbiory centralne Przeglądanie" operacja "Raport zgodności" będzie dostępna, jeśli użytkownik posiada uprawnienie do tej operacji.
Pojawi się nowe okno "Parametry raportu":
Określamy progi zgodności procentowej. Jeśli wybierzemy prezentację kwoty Narastająco od momentu uzyskania zgodności %, w raporcie zgodności będą prezentowane kwoty zrealizowanych świadczeń dla tych ośrodków, które przekroczyły wskazany przez nas próg zgodności. Jeśli wybierzemy opcję Narastająco od początku roku, w raporcie będą wykazywane informacje o zrealizowanych świadczeniach dla każdej jednostki niezależnie od uzyskania przez nią progu zgodności. Raport jest wykonywany dla jednego wybranego województwa i kwartału.
Uwaga! Od 2008 roku zostały zmienione progi zgodności w raporcie zgodności. Ustalane są tylko 3 progi, domyślnie 50%, 75%, 90%. W związku z tym zmodyfikowano szablony raportów, oraz okienko parametrów. Dla lat wcześniejszych raport jest generowany starym sposobem.
Uwaga! Od II kwartału 2009 r. zostały zmienione progi zgodności w raporcie zgodności: 0-70%, 70-90%, 90-100%, 100-110%. Domyślnie ustalone są tylko 3 progi 70%, 90%, 100%.
Uwaga! Od II kwartału 2010 r. zostały zmienione progi zgodności w raporcie zgodności. Dotychczasowe progi zgodności: Próg I: 70%, Próg II: 90%, Próg III: 100% zastąpiono konfiguracją: Próg I: 90%, Próg II: 100%.
Po określeniu wszystkich parametrów wybieramy ikonę 
rozpoczynając generowanie raportu.
Wykonany raport pojawi się w nowym oknie:
Do okna "Lista zbiorów centralnych" powracamy zamykając okno programu Excel, w którym znajdował się wynik raportu.