Użytkownik poziomu wojewódzkiego lub centralnego ma możliwość przeprowadzania kontroli zgodności danych przekazanych w sprawozdaniach resortowych, z danymi przekazanymi w zbiorach centralnych. Po przeprowadzeniu takiej kontroli, jeżeli wynik jej będzie niepoprawny dla danej jednostki (sprawozdanie przekazane przez jednostkę za dany okres sprawozdawczy jest niezgodne ze zbiorem centralnym w zakresie zdefiniowanych reguł), to Użytkownik jednostki, która przeprowadzała kontrolę zgodności danych wysyła do jednostki, która przesłała błędne sprawozdanie, prośbę o wyjaśnienie niezgodności.
W takiej sytuacji wybrana jednostka otrzyma komunikat z prośbą o przesłanie wyjaśnień dotyczących niepoprawnych reguł:
"Sprawozdanie ${symbol} za okres od ${data od} do ${data do} nie spełnia reguł kontrolujących jego zgodność z danymi zbioru centralnego. Jednostka ${nazwa jednostki żądającej wyjaśnień} prosi o wyjaśnienia w tym zakresie. Wyjaśnienia należy przesłać do dnia ${termin}. Aby przesłać wyjaśnienia, należy skorzystać z menu Wyjaśnienia dot. niezgodności sprawozdań i zbiorów centralnych. ${informacje dodatkowe dla jednostek}"
Aby przesłać wyjaśnienie, wybieramy menu Wyjaśnienia dot. niezgodności sprawozdań i zbiorów centralnych.
Wyświetli się lista okresów, dla których użytkownicy poziomu wojewódzkiego lub centralnego, poprosili o wyjaśnienia, dotyczące niepoprawnych reguł walidujących dane zbiorów centralnych.
Aby uzupełnić wyjaśnienia dla niepoprawnych reguł, wykonujemy operację Uzupełnij wyjaśnienia niepoprawnych reguł.
Po jej wybraniu otworzy się lista wszystkich niepoprawnych reguł.
Aby wprowadzić wyjaśnienia dla niespełnionej reguły, zaznaczamy ją na liście i wybieramy ikonę 
.
Uwaga! Nie można modyfikować wyjaśnień dla okresu, za który przekazano wyjaśnienia.
Otworzy się okno, w którym w polu Przyczyna niezgodności wprowadzamy treść wyjaśnienia niespełnienia danej reguły.
Ikona 
obok numeru reguły pozwala na otwarcie podglądu reguły w sprawozdaniu. Na podglądzie zaznaczoną regułą będzie ta, dla której aktualnie uzupełniane są wyjaśnienia.
Zatwierdzamy wprowadzone wyjaśnienia ikoną Akceptuj.
Analogicznie możemy wprowadzić wyjaśnienia dla pozostałych niespełnionych reguł.
Za pomocą operacji Prezentacja niezgodności w sprawozdaniu, dostępnej na liście okresów możemy wyświetlić podgląd wszystkich niespełnionych reguł w sprawozdaniu.
Po uzupełnieniu wyjaśnień dla wszystkich niespełnionych reguł, na liście okresów wykonujemy operację Przekazanie wyjaśnień.
Wykonanie operacji będzie możliwe tylko jeśli użytkownik uzupełni wyjaśnienia dla wszystkich niespełnionych reguł (w kolumnie "Czy wyjaśniono wszystkie niezgodności" wartość Tak) oraz nie przekazał ich wcześniej (pusta kolumna "Termin przekazania wyjaśnień").
Wykonanie tej operacji spowoduje, że uzupełnione wyjaśnienia będą dostępne do wglądu dla jednostki proszącej o wyjaśnienia.
Uwaga! Po wykonaniu operacji "Przekazanie wyjaśnień" nie można już modyfikować wyjaśnień.