Użytkownik pracujący w aplikacji CAS na poziomie wojewódzkim, po wczytaniu do bazy wszystkich zbiorów centralnych przekazanych przez jednostki podległe, w terminie określonym przez Ministerstwo, dokonuje scalenia zbiorów poprzez wybranie operacji 
. Szczegółowy opis wykonania wszystkich czynności wykonywanych w trakcie scalania zbiorów został opisany w rozdziale Scalenie właściwe. Jeżeli już po wykonaniu scalenia, ale przed zatwierdzeniem scalonego zbioru, do aplikacji CAS zostanie wczytany nowy zbiór centralny z jednostki podległej, to aby został on scalony wraz z pozostałymi, należy wykonać jedną z czynności:
- Usunąć scalony zbiór centralny i wykonać ponowne scalenie, które obejmie również nowo wczytane zbiory; aby usunąć scalony zbiór centralny należy zaznaczyć go na liście i wybrać ikonę Usunięcie 
:
- Zmodyfikować zawartość scalonego zbioru centralnego poprzez wybranie opcji Edycja 
. Pojawi się okno zawierające listę scalonych zbiorów:
Za pomocą ikony Dodaj brakujące zbiory 
uzupełniamy listę scalonych zbiorów o nowo dosłane i akceptujemy dane. Kolorem zielonym oznaczone są na liście te zbiory, które zostały dosłane w nowszej wersji niż poprzednio scalona. Po wybraniu ikony Pokaż wszystkie jednostki 
kolorem brązowym będą wyróżnione te zbiory, które nie brały udziału w poprzednim scalaniu.
Scalony zbiór centralny należy zatwierdzić poprzez wybranie operacji 
. Szczegółowy opis zatwierdzania scalonego zbioru centralnego znajduje się w rozdziale Zatwierdzanie scalonych zbiorów centralnych. Zatwierdzenie jest konieczne do tego by na poziomie ministerialnym można było dokonać scalenia zbiorów z całego kraju.
Jeżeli jednostka podległa dośle nam zbiór centralny już po wykonaniu scalenia i zatwierdzenia na poziomie wojewódzkim, to możemy jeszcze cofnąć zatwierdzenie scalonego zbioru i "doscalić" przysłany zbiór w sposób opisany powyżej.
Scalony i zatwierdzony zbiór centralny poziomu wojewódzkiego może zostać scalony na poziomie ministerialnym. Wówczas nie mamy już możliwości cofnięcia zatwierdzenia zbioru na poziomie wojewódzkim. W takim wypadku po otrzymaniu nowych przesyłów z jednostek podległych powinniśmy wykonać kolejne scalenie.
Po ponownym wykonaniu scalenia za pomocą operacji 
na liście zbiorów centralnych będziemy widzieli dwa scalone zbiory centralne z różnymi numerami wykonania. Oczywiście, aby nowo scalony zbiór centralny mógł być wykorzystany na poziomie ministerialnym do wykonania scalenia zbiorów z całego kraju, musimy go zatwierdzić.
W analogiczny sposób postępuje użytkownik na poziomie ministerialnym, gdy po wykonaniu scalenia zbiorów centralnych z 16-u województw okaże się, że po jakimś czasie wykonały one kolejne scalenie. Jeżeli pojawi się scalony zbiór centralny wojewódzki z nowym wyższym numerem wykonania, to użytkownik na poziomie ministerialnym wykonuje jedną z możliwych czynności:
- usuwa scalony niezatwierdzony zbiór centralny wykonany dla całego kraju i wykonuje scalenie od początku
lub
- modyfikuje scalony niezatwierdzony zbiór centralny wykonany dla całego kraju
lub
- cofa zatwierdzenie zbioru centralnego wykonanego dla całego kraju i modyfikuje go
lub
- dokonuje kolejnego scalenia zbioru centralnego dla całego kraju uwzględniając w nim nowe wykonania scalenia zbiorów centralnych wojewódzkich.